Име манастира Есфигмен потиче од грчке речи Спхигмено што знаћи стиснути, јер изгледа као да је стиснут између две планине.Други кажу да је име добио по оснивачу који је имао танак конопац око врата (Спхигменос). По традицији, манастир (који слави Христово васкрснуће) су саградили Тхеодосиус Мицрос и његова сестра, краљица Поулхериа (408-450), која је била Марциано-ова жена. Касније је манастир уништен великом стеном која је пала са планине. Рушевине старог манастира су пола километра даље од данашњег. Нови манастир је подигнут крајем 10. века, од монаха из старог манастира.

Први писани документ о манастиру је писмо Паула Xеропотамитског из 1001. године. Кратко време у 14. веку игуман је био познати Грегорy Паламас, који је каније постао солунски Архиепископ. Два пута у 16. веку гусари су рушили и пљаћкали манастир, али је он наново подугнут. У 17. веку је пао у заборав, али за време руског краља Александра Михајловића добио је много помоћи из Русије као и од других православних хришћана који су помогли да манастир буде обновљен.
За време грчке револуције 1821 Турци су нанели много штете овом манастиру. Од 1850-1858 много нових ћелија је подигнуто. Поред главног храма ту су још и 8 капела. Познати монах Антони Пећерски, оснивач познатог манастира Лавра у Киеву, живео је у овом манастиру у 11. веку. Он је донео мотиве манастира у своју земљу и постао оснивач руског манастирског изгледа. Данас, он је познат као светац.
Библиотека садржи 320 руком писаних докумената,од тога 75 на пергаменту. Један је обрисан и поново написан. Неки од њих имају одличне минијатуре које потићу чак и из 11. века. Такође, ту је и 2500 штампаних докумената. Благо манастира садржи крст Пулхериа-е, изврсну мозаик-икону из 13. века, минијатурне иконе, литургијске објекте, сцептре, крстове, разне мошти (кости светаца), неколико веома вредних докумената, један део Наполеоновог шатора из Египта и друго.